EN aggressiv blodkreft, som først og fremst rammer barn, har 15 forskjellige undertyper, hver assosiert med et spesifikt resultat og respons på medisiner, ifølge en genomisk analyse 1. Arbeidet lover å forbedre behandlingen - for eksempel å spare noen barn fra de tøffeste cellegiftkurene og gi andre de nyeste immunterapiene.

Dette detaljert klassifisering baner vei for målrettede terapier, sier forskere, og tilbyr mennesker med T-celler akutt lymfatisk leukemi (T-ALL) Hope, som står for omtrent 5 % av alle krefttilfeller hos barn. De som er i dagNaturPublisert arbeid kan bidra til å forutsi hvem som er mindre sannsynlig å reagere på behandling og hjelpe leger med å velge mer effektive terapier fra starten av.

"Det er en flott studie som vil være en veldig rik ressurs for alle som behandler T-ALL-pasienter," sier Jan Cools, en genetikkforsker i leukemi ved Flemish Institute of Biotechnology i Gent, Belgia, som ikke var involvert i forskningen.

En degenerert stamcelle

T-ALL oppstår når en mutert stamcelle i benmargen produserer store mengder unormale T-celler, en type immunceller. Selv om overlevelsesraten for T-ALL har forbedret seg med fremskritt innen kjemoterapi, opplever 15-20 % av barn og tenåringer tilbakefall eller har former for sykdommen som ikke reagerer på standardbehandling, ifølge studiemedforfatter David Teachey, en pediatrisk onkolog og forsker ved barnesykehuset i Philadelphia i Pennsylvania. Derfor er det viktig å finne bedre biologiske markører som kan forutsi hvilke personer med T-ALL som trenger målrettede terapier eller nye behandlingsmetoder.

Tidligere hadde forskning identifisert forskjellige undertyper av T-ALL, men ingen studie var stor nok til å pålitelig forutsi en persons sykdomsprogresjon basert på genetiske endringer alene. Så Teachey og hans kolleger analyserte hele DNA-sekvensen til både tumorceller og friske celler fra mer enn 1300 personer med T-ALL som fikk samme behandling. Forskerne undersøkte også cellulært RNA for å forstå hvordan genaktiviteten ble endret i kreftprøvene.

Kobling av genom og utfall

Analysen avdekket 15 forskjellige T-ALL-undertyper, noen tidligere ukarakteriserte. Hver undertype viste unike genetiske endringer og genuttrykksmønstre. Personer med visse undertyper hadde større sannsynlighet for å ha kreftceller igjen i kroppen etter behandling, noe som kan føre til tilbakefall av sykdommen. Personer med andre undertyper var mer sannsynlig å overleve og forbli kreftfrie, og en undertype var mer sannsynlig å føre til en annen type kreft andre steder i kroppen, fant forskerne.

Analysen viste også at nesten 60 % av de genetiske endringene assosiert med T-ALL DNA-seksjoner forekommer som ikke produserer proteiner, men som kan påvirke genaktivitet. Disse endringene førte ofte til upassende aktivering av gener og bidro til kreftutvikling.

Ved å bruke genetiske og kliniske data klassifiserte forskere T-ALL etter risikonivå: veldig høy, høy, lav og veldig lav. Denne klassifiseringen kan hjelpe leger med å skreddersy behandlinger ved å anbefale sterkere kjemoterapi eller nye immunterapier for høyrisikopersoner og mindre aggressive behandlinger for de med lavere risiko, sier Cools.

Studien tiltrakk seg deltakere fra USA, Canada, Australia, Sveits og New Zealand. Fordi en persons genetiske historie kan påvirke deres respons på behandling, må resultatene valideres i forskjellige populasjoner, sier studiemedforfatter Charles Mullighan, en hematolog ved St. Jude Children's Research Hospital i Memphis, Tennessee.

Forskningen fremhever også behovet for å analysere hele DNA-sekvensen til tumorceller hos personer med T-ALL. Selv om denne 'hele genomsekvensen' ennå ikke er mye brukt på grunn av kostnadene, forventer Mullighan at den vil bli mer vanlig i fremtiden. "Studier som dette gir en overbevisende sak om at vi i økende grad bør forfølge helgenomsekvensering for denne typen leukemi."